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基因数据处理52之cs-bwamem集群版运行(1千万条100bp的reads)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:170
1.art生成模拟序列: art_illumina -ss HS20 -i GRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522 . fna -l 100 -c 10000000 -o g38L100c10000000Nhs20 2.上传到hdfs,制定partition数 spark-submit --class cs .ucla .edu .bwaspark .BWAMEMSpark --master spark://maste[详细]
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NDK开发 - JNI数组数据处理
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:86
很多时候利用 NDK 开发都是为了对数据进行加密操作,因为单纯的 Java 太容易被反编译了,加密算法也就很容易被破解,而利用 C/C++ 开发可以加大破解难度。文件的数据加密就需要通过 byte 数组传给 JNI。 传送门: NDK开发 - JNI数组数据处理 JNI 中的数组分[详细]
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利用BI搭建零售业数据信息平台
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:69
某百货公司是全市规模最大的以零售为主、多元化经营的股份制商业企业。拥有员工数千人,经营国内外品牌2300余种,年商品销售额逾10亿人元。 销售体量如此庞大的企业近几年在IT建设上出现了问题,集团内部的信息化数据有些跟不上业务扩张的步伐。虽然该集团很[详细]
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基因数据处理70之Picard安装没成功
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:158
1.下载: https://github.com/broadinstitute/picard.git 2.安装: hadoop@Master:~/xubo/tools/picard$ ant clone-htsjdkBuildfile: /home/hadoop/xubo/tools/picard/build.xmlclone-htsjdk: [exec] Cloning into 'htsjdk'... [echo] Checking out HTSJDK t[详细]
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OBIEE RPD开发
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:50
A parent-child hierarchy is a hierarchy of members that all have the same type. This contrasts?with level-based hierarchies,where members of the same type occur only at a single level of the?hierarchy. The most common real-life occurrence[详细]
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基因数据处理26之avocado运行snap-basic有问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:185
hadoop@Master:~/xubo/data/testTools/se$ avocado-submit /xubo/avocado/hs2 .fq /xubo/avocado/hs38DH .fa /xubo/avocado/test20160527NUMhs2snap /home/hadoop/xubo/data/testTools/se/snap-basic .properties Using SPARK_SUBMIT=/home/hadoop/cloud/spa[详细]
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工具 | R高效数据处理包dplyr和data.table,你选哪个?
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:74
dplyr和data.table是R的两个高效数据处理包,这两个包有它们各自的优点。dplyr包的语法更加优雅,提供了更易于人类所能理解的自然语言。data.table包的语法简洁,并且只需一行代码就可以完成很多事情。进一步地,data.table在某些情况下执行效率更高(见这里[详细]
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如何挖掘大数据“钻石矿”? 李克强绘四大路径
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:155
中新社 刘震 摄 有人将大数据比喻为“21世纪的钻石矿”。如何在新一轮信息化潮流中抢得先机,掘得富矿?中国国务院总理李克强25日在中国大数据产业峰会暨中国电子商务创新发展峰会(以下简称:数博会)上发表致辞时,为此描绘出四大清晰路径。 路径一:大数据[详细]
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数据处理的 9 大编程语言
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:131
(点击 上方公众号 ,可快速关注) 英文:Anna Nicolauo 译者:伯乐在线 - 胡波 链接:http://blog.jobbole.com/100732/ 有关大数据的话题一直很火热。伴随着信息的爆炸式增长,大数据渗透到了各行各业,广泛应用于公司中,同时也使得传统的软件比如 Excel[详细]
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基因数据处理28之avocado运行
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:131
需要注意的是如果使用avocado的命令行,fs和fq为hdfs路径,properties为本地路径: hadoop @Master :~/xubo/data/testTools/se $ avocado-submit /xubo/avocado/hs1.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527 /home/hadoop/cloud/avocado/basi[详细]
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WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:197
标 题: WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程 时 间: 2013-03-17,15:22:33 这是本人第一次做漏洞挖掘,2月的时候开始研究漏洞挖掘技术,2月24号那天在进行Fuzz测试的时候偶然的发现了一个afd.sys未处理的异常,然后就对这个异常如获至宝的分析[详细]
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520我与大数据有个约会——上海大数据创新应用论坛完美落幕
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:187
2016年5月20日周五下午,由上海市大数据联盟牵头,慧与(中国)有限公司、联通小沃科技与华院数据共同承办,来自金融服务业、运营商、零售及电商、制造等行业的大数据应用先行者们为各行各业170余位来宾们打开了一扇通向大数据应用落地彼岸的智慧之门。会议由[详细]
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基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:186
读入的read为: val fqFile = "hs38DHSE1L100F1.sam" 读取结果: cleanedReads. count : 1 { "readNum" : 0 , "contig" : { "contigName" : "chrUn_KN707963v1_decoy" , "contigLength" : 62955 , "contigMD5" : null , "referenceURL" : null , "assembly"[详细]
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基因数据处理32之Avocado运行记录(人造数据集)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:122
主要是需要数据正确,如果中间缺少记录,avocado一般不会成功 1.代码: Avocado修改: /** * Licensed to Big Data Genomics (BDG) under one * or more contributor license agreements. See the NOTICE file * distributed with this work for additional[详细]
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基因数据处理30之avocado运行avocado-cli中的avocado问题1和2
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:191
问题1: avocado中的run方法中: println( "stats.coverage:" + stats .coverage ) 调用的是: lazy val coverage = ComputingCoverage.time { ScoreCoverage(inputDataset) } 然后报错: Exception in thread "main" java .lang .UnsupportedOperationExcep[详细]
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Multiply Strings ---leetcode
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-02 热度:191
Given two numbers represented as strings,return multiplication of the numbers as a string. Note: The numbers can be arbitrarily large and are non-negative. Converting the input string to integer is? NOT ?allowed. You should? NOT ?use inter[详细]
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大素数测试和大数素因子分解
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:147
小黄书第19章p82页根据合数的拉宾-米勒测试可得到素数的必要条件。 参考资料。 以POJ1811 Prime Test 为例。 #includestdio.h#includemath.h#includestdlib.h#includealgorithmusing namespace std;typedef long long LL;const int S=20;LL pfact[10005],[详细]
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从人性出发,5步挖掘用户需求
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:148
做一个产品之前,常常最要做的就是挖掘用户的需求。也有了那些用户调研,市场分析,竞品分析等等,最后落地成产品功能。很多大拿都说过,要满足人性七宗罪等。但往往落实下来很难,感觉很虚,作者也迷茫了一段时间。恰巧这次美团架空了大众点评的事情,让作[详细]
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数据处理的两个基本问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:110
第八章 ? 本章概述 : 1. ????????? 计算机是进行数据处理、运算的机器,那么有两个基本的问题就包含在其中 : 1) ?? 处理的数据在什么地方? 2) ?? 要处理的数据有多长? 这两个问题,在机器指令中必须给以明确或隐含的说明,否则计算机就无法工作。 2. ???[详细]
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如何将机器学习技术应用到文本挖掘中
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:128
本挖掘典型地运用了机器学习技术,例如聚类,分类,关联规则,和预测建模。这些技术揭示潜在内容中的意义和关系。文本发掘应用于诸如竞争情报,生命科学,客户呼声,媒体和出版,法律和税收,法律实施,情感分析和趋势识别。 在本篇博客帖中,你将会学习到如[详细]
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述符有多好和在特殊情况下如何考虑相似性等问题
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:184
http://bb.iyaya.com/linyifan2006/riji-14417556.html http://bb.iyaya.com/2007121/riji-14417521.html http://bb.iyaya.com/132618hh/riji-14417543.html http://bb.iyaya.com/438586550/riji-14417544.html http://bb.iyaya.com/53231288/riji-14417546.[详细]
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大数据分析技术生态圈一览
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:173
大数据分析技术生态圈一览 人人都说大数据,但很多人对这个领域并非真正地了解。为了帮助你,我们决定制作这份厂商图标和目录。它并不是全面列出了这个领域的每家厂商,而是深入探讨大数据分析技术领域。我们希望这份资料新颖、实用。 作者: 来源:网络 | 2[详细]
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医疗行业大数据应用案例(华大基因、大数据预测早产、大数据调配
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:91
文章从华大基因推出肿瘤基因检测服务、大数据预测早产儿病情、广东省人民医院利用大数据调配床位3个医疗行业大数据应用案例中,以应用背景、数据源、图说场景、实现途径、应用效果5个视角去看待大数据在医疗的应用状况。 案例一:华大基因推出肿瘤基因检测服[详细]
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搭建大数据处理集群(Hadoop,Spark,Hbase)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:98
搭建Hadoop集群 配置每台机器的 /etc/hosts保证每台机器之间可以互访。 120.94.158.190 master 120.94.158.191 secondMaster 1、创建hadoop用户 先创建hadoop组 sudo addgroup hadoop 然后再建一个hadoop用户加入到hadoop组,(前一个为组,后一个为用户) s[详细]
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【杭电oj】1715 - 大菲波数(大数递推)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-01 热度:90
点击打开题目 大菲波数 Time Limit: 1000/1000 MS (Java/Others)????Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Others) Total Submission(s): 17138????Accepted Submission(s): 5689 Problem Description Fibonacci数列,定义如下: f(1)=f(2)=1 f(n)=f(n-1)+f(n-[详细]
